Liberar espacio o reparar la base de datos de Zabbix

A veces en instalaciones de zabbix que llevan un tiempo en funcionamiento y que se han ido actualizando nos econtramos que el fichero ibdata1 es de un tamaño enorme. Eso es debido a que en MySQL cuando usamos InnoDB, todas las tablas e indices se almacenan bajo la tabla system de MySQL, que se corresponde con el fichero ibdata1, que se encuentra en la carpeta /var/lib/mysql

La solución a dicho problema es el siguiente :

Editamos el fichero /etc/my.cnf y añadimos la siguiente líenea bajo la sección [mysqld]

Reiniciamos la BDD

Referencias

http://www.thegeekstuff.com/2016/02/mysql-innodb-file-per-table/